Nat Biotechnol:科学研究不能重复?可能是HeLa细胞系“变”了

2021-11-03 08:13:57 来源:
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HeLa线粒本体仍未在亚洲地区的许多实验者室指导了有约70年,并且依然被忽视是无限供应的恒定的并不相同线粒本体。然而,2月18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新分析断定,线粒本体在相同实验者室错综复杂长期存在较大相似之处,这引发了对线粒本体则有分析值得注意的质疑。“我很高兴看见这项分析,但在某种意义上我并不深感惊讶,”拉塞尔巴尼莉癌症中都心的大分子病理学家Prasad Jallepalli时说,他没有参与这项分析。这并不是HeLa线粒本体则有自开端以来第一次显现多样化的报道:多年来,其他分析小组也证明HeLa线粒本体相异本体错综复杂在DNA序列和RNA表达的许多现代相似之处。这项有约期分析首次全面分析了各种HeLa相异本体的遗传相异(相同种产品的HeLa线粒本体则有生活在亚洲地区的各个实验者室),并且首次证明遗传关联连续性导致了RNA表达和表型的变动。HeLa线粒本体“变了”?在这项分析中都,分析其他部门从6个国家的13个实验者室抽取了14份HeLa取样,并在并不相同的实验者室必需下顺利进行指导。他们首先量化了DNA拷贝数相异,揭示了它们原核生物错综复杂的许多现代相似之处。结果找到,HeLa相异本体错综复杂,尤其是CCL2和Kyoto相异本体错综复杂长期存在着巨大的关联连续性。进一步的分析断定,许多这些遗传相似之处转成为mRNA造成了的变动,并且在较小素质上转成为RNA原子量的变动。分析其他部门通报时说,HeLa CCL2和Kyoto线粒本体则有的转录组和RNA组谱彼此错综复杂的相似之处,就像来自两种相同种类组织的免疫线粒本体则有错综复杂的相似之处一样。HeLa相异本体在指导愈来愈进一步中都生长速率也相同,一些线粒本体集合起来无需17.5小时才能翻倍,而另一些线粒本体在并不相同的指导必需下无需话费将有约32小时。它们对致病感染的反应也有所相同:与其他两种相异相比较,一种相异对感染的敏感连续性低,分析其他部门将其归因于长期的RNA一氧化氮,这种RNA一氧化氮在寄生虫进入宿主线粒本体中都起作用。在一项除此以外的实验者中都,分析小组通过指导线粒本体则有三个月,来观察HeLa相异本体的表征究竟亦会随着时间发生变动。分析其他部门记录了愈来愈早线粒本体和晚期线粒本体错综复杂表征相似之处大约6%。苏黎世联邦理工学院大分子则有统病理学分析所的Ruedi Aebersell教授是该分析的合着者,他时说,“即使在同一个实验者室那时候,这些线粒本体的相似之处和变动速率也是非常惊人的。”他少于,如果一个分析生在单项开始时用HeLa线粒本体则有做了一个实验者,并在六个月后被拒绝重复这个实验者,他们或许亦会得到相同的结果。关于分析中都的“可遗传物质连续性危机”的讨论大多数集中都在实验者设计、统计学层面的瑕疵,以及作为主要驱动因素的受水污染或贴错标签的线粒本体则有。但是Aebersell忽视,HeLa线粒本体则有和免疫线粒本体则有的病理学相似之处或许是关键。为什么亦会“变”?斯坦福大学的线粒本体病理学家Tim Stearns忽视有几个或许的情况可以解释为什么线粒本体则有在长时间指导下亦会发生变动。首先,HeLa线粒本体是已知原核生物周期连续性免疫线粒本体,因此很或许随时间随机突变。此外,它们还亦会在实验者室中都受到各种生长必需的影响,这或许亦会进一步线粒本体生物出独具的特征。例如,他时说,灵长类线粒本体的指导有数将其指导到充满一个试管为止,从试管中都抽取一部分线粒本体,然后将它们放于另一个试管中都生长,这一愈来愈进一步称为分裂。“每个人做这件多事的模式都看上去相同,”他时说道。有约期这些找到,对于人类指导线粒本体的分析结果的解释和重现连续性有一定的意义。Aebersell和他的老友在论文中都重申了几个具本体的解决方案。首先,分析其他部门一定会使用免疫线粒本体则有的愈来愈早传代,并确保在同一线粒本体则有的相同取样中都重复同一线粒本体则有的实验者。愈来愈不可或缺的是,病理学家一定会清楚地通报他们在formula_的分析中都使用的线粒本体则有相异本体。
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