Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘成出人类肠道的微生态系统目录!

2022-02-07 06:42:25 来源:
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近日,一项刊文在国际性刊物Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的信息深入研究报告中所,来自欧洲分子生物学实验室等机构的研究小全体成员们通过信息深入研究将有MS消化道病原体全体成员中所所有仅有的病菌遗传物质增补变为了一个大型的信息库,从而就能协助信息深入研究医护人员深入即使病菌基因和蛋白二者之间的区别,以及其对有MS健康的严重影响。

病菌遍布消化系统内外,其能够产生细胞内来严重影响MS消化、健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于消化系统病原体全体成员变为员的存量要人中所卵子还要多,有数病菌、菌类和其它病原体;为了理解病菌在有MS生物学中所所扮演的决定性配角,研究小全体成员们通常不会在实验室中所分离出来并对其指导,随后在对病菌同步进行DNA测序,然而以外很多病菌还无法在实验室的生态中所被指导繁殖。

为了得到这些病菌的具体信息,信息深入研究医护人员无视了另外一种新方法,他们从生态中所(比如消化道)查阅单独检验,随后在对整个检验中所的DNA同步进行测序,然后利用计算机新方法对来自单独检验中所的数千种品种的个体遗传物质同步进行修缮,这种新方法被被称作俊遗传物质学高效率,该高效率能作为一种替代新方法对单个品种的DNA同步进行分离出来和测序。

信息深入深入研究Rob Finn指出,去年有数我们在内的三个独立国家设计团队修缮了变为千上万个消化道病原体全体成员遗传物质,而第二大的原因就是这些设计团队所得到的结果应该具有可比性,以及应该能将这些结果增补变为为一个更加全面的清单。以外信息深入研究医护人员早已从有MS消化道中所将近4600种病菌种群中所增补了20万个遗传物质和1.7亿个细胞内基因全体成员,这种新型的信息库(统一的有MS胃消化道遗传物质集合和统一的胃消化道细胞内参考资料)了解到了MS消化道的巨大重要性,并为全面性同步进行消化道病原体全体成员信息深入研究铺平了道路。

信息深入深入研究所画出的这个巨大的参考资料是病原体全体成员信息深入研究的一个转捩点,未来或将能为研究小全体成员们透过更加宝贵的资源来信息深入研究有MS消化道生态系统中所每一种病菌所扮演的决定性配角。这项信息深入研究证明,将近70%被侦测到的病菌从而在实验室中所被变为功指导过,而其在体内的活性依然未知,而这类病菌中所第二大的族裔就是Comantemales;信息深入深入研究指出,看到Comantemales如此尤其真是一个惊喜,这就不言而喻了我们的确对消化道中所的病菌知之甚少,我想这个参考资料能协助生物信息学家和分子生物学家在未来几年弥补这一专业知识空白。

该信息库/参考资料查阅的所有信息都能在在线资源Mgnify中所得到,其能协助研究小全体成员们深入研究病原体的遗传物质信息并且与当前的信息库同步进行对比;随着世界各地信息深入研究设计团队不断释出重新信息库,该参考资料不必要扩大到有数其它MS部位的病原体全体成员,比如表皮或口腔外部等部位。之前信息深入深入研究指出,这一参考资料的增补未来或为病原体学家和临床信息深入研究医护人员透过更加丰富的资源,然而信息深入研究医护人员不必要在南美洲、东南亚和美洲等近现代太少的地区发现更多重新病菌品种,以外信息深入研究医护人员并不清楚并不相同人群中所病菌重要性的歧异和变化状况。

原始引自:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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