Cell | 建立人类树突状细胞内与辅助性T细胞内相互作用模型

细胞会-细胞会电磁场异常适合于，涵盖大量分子会与频谱路中，学界精研多年，仍旧是管中窥豹。来自法国巴黎PSL研究工作大学的Vassili Soumelis团队于在Cell刊物上登载月显露版A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的篇文章，确立了物理与理论为基础的研究工作方法，物理上，在蛋白质高度检查了细胞会所黏液的细胞会因子与应激反应；理论上，确立了频谱输入反向之数间的联系和电磁场的关系。创作者以全人类树突状细胞会（Dendritic cell，原称DC）与这两项T细胞会（T Helper cell，原称Th）之数间的电磁场为研究工作对象，统计分析了36例DC无关的频谱分子会和17种Th黏液的细胞会因子，并依靠这些数据集确立数学数学方法，演算显露56种已经被物理推断显露的细胞会彼此之数间的关系，与此同时，还推断显露显露290种可能的关系，并推断显露了IL-12p70可以通过IL-1频谱路中可借17M-这两项T细胞会（原称Th17）。首先，创作者通过观察了全人类单核细胞会来源的DC（MoDCs）和外周体内CD11c+DC（bDCs）两类细胞会，并抑制24小时。所采行的抑制频谱主要值得注意三大类多达14种。第一种：内源频谱分子会，还包括趋化因子beta（interferon β，原称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样受体的合成酶，还包括Toll4受体的胺类脂多糖（ lipopolysaccharide，原称LPS），Toll1/2受体胺类PAM3CSK4，Dectin1胺类Curdlan，Toll2/Dectin1胺类 zymosan，Toll7/8受体胺类R848，Toll3受体胺类 poly(I：C) 和NLRP3炎症小体活化剂铝钾；第三种：细变形虫病毒，还包括高温灭活的Candida albicans （原称HKCA），多蒙特变形虫（Listeria monocytogenes，原称HKLM），Staphylococcus aureus （原称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （原称HKSP）和流感病毒（influenza virus，原称flu）。月里，创作者通过流式细胞会拳法等方法，检查了36种DC无关分子会的理解可能，其中，29种处于细胞会表面，7种处于细胞会黏液上清之中。表明，除了一些已知的DC细胞会组织起来都是，创作者还有了一些新发现：（1）zymosan抑制的MoDCs 理解高高度的CD54 和PVR；（2）流感病毒抑制的MoDCs可以可借ICOSL；（3）LPS抑制的MoDCs 可以可借高高度的CD30L和CD83。再依然，创作者将这些抑制过的DC与T细胞会名教授6天，随后检查Th的游离效率以及17种Th无关细胞会因子的理解黏液可能。有趣的是，创作者将Th和DC的乏善可陈彼此之数间相对，发现，这二者之数间并不存在一一对应的的关系，也就是说，两种抑制物对DC产生的视觉效果多种不同，但是，这两种抑制物所处理的DC与T细胞会名教授之后，产生的视觉效果很可以截然不同。接着，创作者采行生物的资讯学的方法，以上述物理数据集确立数学方法。简单来说，创作者立体化DC反向的36种频谱分子会和Th反向的17种畸变分子会，将两两之数间的的关系简化为“持续性抑制”和“倒数第向抑制”两种，并且，还加入数据集库和已登载文献中的的资讯，确立了适合于的频谱抑制互联。例如，通过这一数学方法，创作者发现， IL-10的倒数第向抑制分子会还包括OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而持续性抑制分子会还包括Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，得不到DC不同的抑制频谱，创作者就可以可知Th组织起来细胞会IL-10的理解黏液可能。最后，创作者利用这样数学方法，试平面图推断显露并推断显露新细胞会彼此之数间的关系。通过确立的数学方法，创作者发现，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2协同黏液时，倾向于抑制IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 协同经常显露现时，则格外倾向于抑制IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的理解高度都显着降低。这些结果所述，IL-12参与Th17的可借分化。为了进一步阐释IL-12可借Th17的机制，创作者采行体外可借Th的数学方法，发现，IL-12并不能直接可借Th17，但是，同时加入IL-1和IL-12，Th17就可借显露来了。这是一篇物理与理论为基础的佳作。物理结果与推算三维彼此之数间支持，彼此之数间指导，息息相关。如下平面图表，物理部分采行了密切关联两部分数据集，一是何种抑制下DC细胞会的组织起来，二是组织起来后的DC对T细胞会的作用。理论部分以DC和T细胞会的反向细胞会因子为核心，确立了细胞会因子之数间的持续性和倒数第向抑制互联数学方法。通过这一数学方法，创作者预测显露一些新细胞会数间彼此之数间的关系，最终再用物理推断显露这些的关系确实确有。这篇篇文章的亮点有临近，一是确立和物理理论为基础研究工作的范本，二是篇文章中提供的诸多细胞会抑制的资讯以供研究工作参考。原始显露处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.